國内首批PacBio Sequel Ⅱ實測數據發布~
2019.05.21


PacBio Sequel Ⅱ作為三代測序行業的新寵,正式入駐安諾優達短短12天,就已完成國内首批數據的測試。下面就讓小編帶大家一睹最新的Sequel Ⅱ下機數據吧~



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PacBio Sequel Ⅱ針對不同類型的研究,兼容HiFi和CLR兩種測序模式。在本次測試中,優先選擇了CLR測序模式中15 kb和20 kb DNA文庫,分别試測1個SMRT®Cell,對下機數據進行質控統計。下面就和各位老師們分享不同插入片段文庫的實測數據結果。


15kb DNA文庫


使用微生物DNA構建15 kb DNA 文庫進行1個SMRT®Cell測序,共計産出96.26 G,排除循環測序造成的增加數據,獲得Unique Molecular 序列72.54 G,酶讀長平均長度15 kb,N50為25.6 kb,Subreads 平均長度為11.2 kb,N50為17.6 kb。


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20kb DNA文庫


使用植物DNA構建20 kb文庫進行1個SMRT®Cell測序,共計産出102.84 G,獲得Unique Molecular 序列83.17 G,酶讀長平均長度15 kb,N50為25 kb,Subreads平均長度為12.4 kb,N50為19.2 kb。


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從目前展示的實測數據來看,安諾基因Sequel Ⅱ單個SMRT®Cell數據産出超過100 G,較官方發布的數據(平均80 G)相比在通量上具有很大的提升。後續安諾優達将繼續對CLR測序模式下的30~40 kb DNA文庫以及HiFi測序模式下的10 kb DNA文庫和ISO-seq文庫進行試測,并将在第一時間發布測試結果,敬請期待吧~


自2017年推出三代測序服務以來,安諾優達先後引進了10台PacBio Sequel和2台Sequel II測序儀産品服務類型涵蓋三代基因組組裝、人重測序、動植物重測序、全長轉錄組測序等;累計完成三代項目超800+,其中組裝經驗涉及中草藥、林木、農作物、海洋生物、哺乳動物、昆蟲和人等。日前,安諾優達宣布啟動了ATCG(Annoroad Typical Chinese Genomes Database)數據庫二期計劃,旨在建立領先的“二代+三代”中國人群基因組數據庫,助力挖掘中國人群特有的可靠變異,進一步推動三代測序在中國人群健康研究中的應用。


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